Minato là 1 trong những tài năng thiên bẩm xuất sắc nhất mà giới ninja từng có. Minato đã tạo ra Rasengan, 1 thuật không cần sử dụng đến ấn chú, mà thay vào đó là sự tập trung chakra thành 1 khối cầu trong lòng bàn tay, khiến nó tạo ra sát thương cực lớn cho mục tiêu. Anh vốn định kết hợp hệ chakra của mình vào trong chiêu Rasengan, đáng tiếc do mất sớm nên việc này lúc đó đành dang dở. Kiến thức của anh về thuật phong ấn rất cao do Kushina, vợ anh là chủ thể của Cửu Vĩ, cũng như việc anh là một trong hai người có thể thi triển thuật phong ấn Phong Quỷ Thi Tận, người còn lại là Hokage đệ Tam. Nhằm giúp Naruto có thể sử dụng chakra Cửu Vĩ, Minato đặt một ấn tứ tượng (Yonsho fuuin - Four Symbols Seal) vào cậu. Ngoài ra, anh là một trong số ít người có thể sai khiến trùm cóc Gamabunta cùng chiến đấu với mình (người còn lại là Jiraiya và Naruto.)

Khó mà xác định sức mạnh thật sự của Minato trong chiến đấu. Anko Mitarashi, học trò của Orochimaru, khi thảo luận với đệ Tam về vấn đề sức mạnh đáng gờm và âm mưu của Orochimaru lúc bấy giờ đang đe doạ Làng Lá, đã ước rằng phải chi Minato còn sống để chống lại hắn.

Trong suốt đại chiến ninja lần 3 (Third Great Shinobi War), mệnh lệnh "flee-on-sight" - "thấy là chạy" đã được ban ra trong tất cả ninja thuộc phe địch, nếu như phát hiện thấy Minato có mặt trên chiến trường. Đây là do thuật Phi lôi thần (Hiraishin), khiến anh có thể dịch chuyện tới bất kì vị trí nào. Khi sử dụng phong ấn kết hợp với những thanh kunai, anh có thể quét sạch 1 trung đội chỉ trong chớp mắt. Khi dùng thuật này di chuyển, nhân dạng của anh chỉ còn có thể nhìn thấy là vệt mờ ảo do mái tóc vàng của mình tạo ra. Cũng từ đây mà danh hiệu "Tia Chớp Vàng Của Làng Lá" ra đời.